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ICS65.020.30 B41 D B 32 备案号: 江 苏省地方标准 DB32/T1775—2011 I型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR方法 MethodofRT-PCRdetectingDuckVirusHepatitisI 2011-05-06发布 2011-07-06实施 发布 江苏省质量技术监督局 DB32/T1775—2011 前 言 为规范I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术,提高鸭肝炎病毒检测的灵敏度、稳定性、特异性,特 制定本标准。 本标准按GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分:标准结构和编写》编制。 本标准的附录A为规范性附录。 本标准由江苏省农业科学院提出。 本标准起草单位:江苏省农业科学院。 本标准起草人:魏雪涛、李银、刘宇卓、张敬峰。 I DB32/T1775—2011 I型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR方法 1范围 本标准规范了I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术RT-PCR的所用引物大小、所涉及的样品范围、操 作流程、反应条件等技术标准。 本标准适用于检测鸭肝脏和病毒尿囊液中I型鸭肝炎病毒核酸。 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的,凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法 NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样 3方法原理 聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定 的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。PCR技术却以其快速、敏感和特异等优点在动物疫病检测 中得到广泛应用,而且随着PCR技术的不断改进,这种针对病原核酸的诊断方法表现出更准确、灵敏和 特异的特点。本标准选取了DHVIVP1基因的保守,设计了一对特异性引物,经过了PCR条件的优化、特 异性实验、敏感性试验等,对DHVI的鉴定具有很高的准确性。 4仪器设备和主要试剂 4.1仪器设备:PCR仪,离心机,电泳槽,微量移液器,凝胶成像系统 4.2主要试剂:TRIZOL,氯仿,异丙醇,无水乙醇, 焦碳酸二乙酯(DEPC)处理的灭菌双蒸水,AMV 反转录酶,5×AMVBuffer,10mmol/LdNTPs,RNA酶抑制剂,25mmol/LMgCl2,EXTaqDNA聚合酶, 10×EXTaqDNA聚合酶buffer,2.5mmol/LdNTP,DNAMarkerDL-2000,琼脂糖。 5引物 上游引物:5′-ATCTAATGTCCCGATACAAGGTG-3′; 下游引物:5′-ACGCTAGTGTTTTGAGTCTAAGGC-3′。 6样品采集 按照NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样方法,病死或扑杀鸭,无菌采集肝脏组织。 7方法步骤 1 DB32/T1775—2011 试验用水:按照GB-T6682-2008三级水标准 7.1样品处理 取病料0.5g~1g置研钵中剪碎并研磨,反复冻融研磨,将研磨好的组织,用生理盐水1︰5稀释,以 4℃12000r/min离心10min,取上清200μL备用。 阴性对照:没有发病的正常鸭肝脏 阳性对照:用中和试验检测DHV阳性肝脏样品(见附录A) 7.2DHVRNA的提取 取已处理的待检样品,以DHV阳性病毒为阳性对照,以正常肝脏作为阴性对照,无菌水为空白对照, 每管依次加入Trizol600μL,振荡混匀后,室温放置10min,加入氯仿200μL,剧烈振荡后,室温放 置1min,4℃12000r/min,离心15min,取上层水相750μL,加入500μL异丙醇,混匀,﹣20℃放置 15min,4℃12000r/min,离心15min,去上清,缓缓加入75%乙醇1mL洗涤,4℃8000r/min离心5min, 去上清,室温干燥RNA样品沉淀20min,加入DEPC水10μL,使充分溶解。 7.3RT-PCR 反转录反应:5×AMVBuffer4μL、10mmol/LdNTPs2μL、下游引物1μL、RNA酶抑制剂0.5 μL、RNA模板10μL,AMV反转录酶0.5μL,H2O(DEPC处理)2μL,总体积为20μL,瞬间离心混 匀,65℃反应15min,42℃孵育1h,95℃5min,同时设立阴性、阳性对照,产物于﹣20℃保存备用。 PCR的反应:按25μL体系进行,含MgCl2(25mmol/L)1.5μL,灭菌水15μL,反转录产物4μL, 10×EXTaqDNA聚合酶buffer2.5μL,2mmol/LdNTP0.5μL,上、下游引物50pmol/μL各0.5μL, EXTaqDNA聚合酶0.5μL。94℃3min,然后进入循环94℃30s,52℃30s,72℃30s,30个 循环,于72℃延伸10min,4℃保存。 7.4结果观察 将PCR反应产物于1.2%琼脂糖凝胶进行电泳,电压为120V,时间30min,紫外灯下观察结果,并 进行拍照。 8结果判定 在阳性对照出现相应扩增带、阴性对照无此扩增带是判定结果。 检测样品出现与阳性对照相同目的条带大小为365bp的扩增片段是,判定为该样品为I型鸭肝炎核酸 阳性;否则判定维阴性。 如果阳性对照无相应的目的条带,可能是存在操作失误,该试验需要做重复试验;如果阴性对照有 相应的目的条带,可能是阴性对照存在污染或是操作失误,该试验需要做重复试验。 2 DB32/T1775—2011 附录A (规范性附录) 阳性样品的制备 用中和试验检测DHV阳性肝脏样品,阳性样品按如下方法制备: 首先,无菌采集新鲜DHV阳性鸭肝脏,用无菌的剪刀剪碎并称量,然后以质量比1∶5加入DEPC (diethypyrocarbonate 焦碳酸二乙酯)水,研磨成悬液,装入用DEPC处理过的离心管中,于﹣20℃ 反复冻融3次,以12000r/min,冷冻离心20min,取上清接种11日龄鸭胚,0.1mL/枚。置37 ℃恒 温箱继续培养,每天照蛋观察3次。弃去24h前死亡胚,无菌收获24~120h死亡胚液,无菌分装,并 进行病毒效价测定,病毒含量(EID50)达到10 -3 /0.1mL以上,即可作为阳性对照,﹣20℃保存备用。 3