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DB32∕T_1774-2011鸭H9_亚型禽流感病毒与副粘病毒的检测双重RT-PCR_方法PDF

liugan99
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更新时间:2022/3/21(发布于江苏)

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文本描述
ICS65.020.30 B41 D B 32 备案号: 江 苏省地方标准 DB32/T1774—2011 鸭H9亚型禽流感病毒与副粘病毒的检测 双重RT-PCR方法 MethodofMultiplexRT-PCRdetectingH9SubtypeAvianInfluenzaVirus (AIV)andDuckParamyxovirus(DPV) 2011-05-06发布 2011-07-06实施 发布 江苏省质量技术监督局 DB32/T1774—2011 前 言 为规范鸭H9亚型禽流感病毒与鸭副粘病毒双重RT-PCR分子生物学检测技术,提高两种病毒混合 感染检测的灵敏度、稳定性、特异性,特制定本标准。 本标准按GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分:标准结构和编写规则》编制。 本标准由江苏省农业科学院提出。 本标准起草单位:江苏省农业科学院。 本标准起草人:魏雪涛、李银、刘宇卓、张敬峰。 I DB32/T1774—2011 鸭H9亚型禽流感病毒与副粘病毒的检测双重RT-PCR方法 1范围 本标准规范了鸭H9亚型禽流感病毒与副粘病毒分子生物学检测技术RT-PCR的所用引物大小、所涉及 的样品范围、操作流程、反应条件等技术标准。 本标准适用于鸭H9亚型禽流感病毒与副粘病毒单独或者混合感染的实验室诊断、临床诊断、流行 病学调查、分离毒株的鉴定,适用于鸭组织、分泌物、排泄物和鸭胚尿囊液中H9亚型禽流感病毒和副 粘病毒核酸的检测。 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的,凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法 NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样方法 NY/T772-2004禽流感病毒RT-PCR试验方法 3原理 聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定 的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。PCR技术却以其快速、敏感和特异等优点在动物疫病检测 中得到广泛应用,而且随着PCR技术的不断改进,这种针对病原核酸的诊断方法表现出更准确、灵敏和 特异的特点。又因为双重RT-PCR技术具备1次PCR可以鉴别诊断2种混合感染的不同病原体的独特优势, 现已成为动物病原检测的重要方法之一。本标准参考了NY/T772-2004中H9AIV的检测方法,并根据 GenBank上公布的鸭副粘病毒(DPV)血凝素HA基因序列的保守序列设计一对特异性引物,保证了扩增的 准确性,该方法可以同时鉴定两种病毒的单一感染和混合感染。 4仪器设备与主要试剂 4.1仪器设备:PCR仪,离心机,电泳槽,微量移液器,凝胶成像仪 4.2主要试剂:TRIZOL,氯仿,异丙醇,无水乙醇,焦碳酸二乙酯(DEPC)处理的灭菌双蒸水,AMV反转 录酶,5×AMVBuffer,10mmol/LdNTPs,RNA酶抑制剂,25mmol/LMgCl2,EXTaqDNA聚合酶,10× EXTaqDNA聚合酶buffer,2.5mmol/LdNTP,DNAMarkerDL-2000,琼脂糖。 5引物 5.1反转录引物 H9AIV:5′-AGCAAAAGCAGG-3′ DPV:5′-GGAGGATGTTGGCAGCATT-3′ 1 DB32/T1774—2011 5.2PCR扩增引物 H9AIV:上游引物:5′-TCAACAAACTCCACCGAAACTGT-3′; 下游引物:5′-TCCCGTAAGAACATGTCCATACCA-3′。 DPV:上游引物:5′-TTGATGGCAGGCCTCTTGC-3′; 下游引物:5′-GGAGGATGTTGGCAGCATT-3′ 6样品采集 按照NY/T541-2002,病死或扑杀鸭,取鸭肺脏、脾脏等组织;待检活鸭用棉拭子蘸取气管分泌物 或者泄殖腔排泄物,置于50%甘油生理盐水中。 阴性对照:没有发病的正常鸭肺脏、脾脏等组织 阳性对照:用阳性抗体进行血凝抑制试验检测的阳性尿囊液 7方法步骤 试验用水:按照GB-T6682-2008三级水标准。 7.1样品处理 取待检病料0.5g~1g置研钵中剪碎并研磨,反复冻融研磨,将研磨好的组织用生理盐水1︰5稀释, 稀释液12000r/min离心10min,取上清200μL备用。分泌物和排泄物样品的处理,将喉拭子或者泄殖腔 拭子在50%甘油生理盐水中充分捻动、挤干后弃去拭子,4℃12000r/min离心10min,取上清200μL 备用。 7.2病毒RNA的提取 取已处理的待检样品,以含H9亚型AIV、DPV和两种病毒混合液为阳性对照,以正常SPF鸡胚尿囊液为 阴性对照,无菌水为空白对照,每管依次加入Trizol800μL,振荡混匀后,室温放置10min,加入氯 仿200μL,剧烈振荡后,室温放置1min,4℃12000r/min,离心15min,取上层水相750μL,加入500 μL异丙醇,混匀,-20℃放置15min,4℃10000r/min离心10min,去上清,缓缓加入75%乙醇1mL 洗涤,4℃8000r/min离心5min,去上清,室温干燥20min,加入DEPC水10μL,使充分溶解。 7.3RT-PCR 反转录反应:5×AMVBuffer4μL、10mmol/LdNTPs2μL、两种下游引物各1μL、RNA酶抑 制剂0.5μL、RNA模板10μL,AMV反转录酶0.5μL,H2O(DEPC处理)1μL,总体积为20μL, 瞬间离心混匀,65℃反应15min,42℃孵育1h,95℃5min,同时设立阴性、阳性对照,产物于 -20℃保存备用。 PCR的反应:按25μL体系进行,含MgCl2(25mmol/L)1.5μL,灭菌水14μL,反转录产物4μL, 10×EXTaqDNA聚合酶buffer2.5μL,10mmol/LdNTPs0.5μL,50pmol/μL两种上、下游引物各0.5 μL,EXTaqDNA聚合酶0.5μL。94℃3min,然后进入循环94℃30s,54℃30s,72℃30s, 30个循环,于72℃延伸10min,4℃保存。 7.4结果观察 将PCR反应产物于1.2%琼脂糖凝胶进行电泳,电压为120V,时间30min,紫外灯下观察结果,并 进行拍照。 2 DB32/T1774—2011 8结果判定 在阳性对照出现相应扩增带、阴性对照无此扩增带是判定结果。 被检样品出现732bp条带时,判定H9亚型禽流感病毒核酸阳性; 被检样品出现363bp条带时,判定副