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DB21T_2327-2014猪圆环病毒2型实时荧光PCR检测方法PDF

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DB21T
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更新时间:2022/4/16(发布于山东)

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文本描述
ICS11. 220 DB21B41 辽 宁省地方标准DB 21/ T2327—2014猪圆环病毒 2型实时荧光PCR检测方法Method of real time fluozescent PCRfor the detection of porcine circovirus type 22014 -07 -05发布2014 - 09 -05实施辽宁省质量技术监督局发布 DB21/ T2327—2014 前言本标准按照 GB/T 1.1—2009给出的规则起草。本标准由辽宁省动物疫病预防控制中心提出。本标准由辽宁省畜牧兽医局归口。本标准起草单位:辽宁省动物疫病预防控制中心、辽宁省动物医学研究院。本标准主要起草人:于学武、顾贵波、赵晓彤、崔基贤、陈瑶、魏澍、马建山、王竹、申贯男、赵凤菊、李璐、李晓楠、于丹、王海丰I DB21/ T2327—2014 猪圆环病毒 2型实时荧光PCR检测方法1 范围本标准规定了猪圆环病毒 2型(porcine circovirus type 2,PCV2)实时荧光PCR检测方法的实验技术要求。本标准适用于 PCV2的诊断、监测及流行病学调查,适用于猪脏器、血液、排泄物和细胞培养物中PCV2核酸的检测。本标准中的试验操作应在生物安全Ⅱ级(BSL-2)以上的实验室进行。2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。兽医实验室生物安全技术管理规范3 缩略语下列缩略语适用于本标准。PCV2:猪圆环病毒 2型(porcine circovirus type 2)HS Taq酶:热启动Taq DNA聚合酶(HS Taq DNA polymerase)Ct值:达到阈值的循环数(cycle threshold)DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid)实时荧光 PCR:荧光聚合酶链式反应(real time fluozescent quantitative polymerase chain reaction)PBS:磷酸缓冲液(phosphate buffer solution )4 原理根据 PCV2基因特定序列的保守片段,合成一对特异性引物和一条特异性探针。荧光探针的5’端标记 FAM荧光素,3’端标记TAMRA荧光素,3’端的淬灭基团在近距离内能吸收5’端报告荧光基团发出的荧光信号。但在扩增时,由于 Taq酶的5’→3’的外切活性,在延伸到荧光探针时,将探针切断,两基团分离,淬灭作用消失,荧光信号产生。因此,可通过检测荧光信号对核酸进行检测。5 仪器和器材5. 1 仪器主要仪器有分析天平、高速离心机、荧光 PCR扩增仪、-70℃冰箱、-20℃冰箱、水浴锅、可调移液器(最大量程为 2μL,20μL,200μL,1000μL)。1 DB21/ T2327—2014 5. 2 器材主要器材有组织匀浆器或研钵、眼科剪、眼科镊、10 mL一次性注射器、1.5 mL灭菌离心管、PCR八联排管或 96孔板、吸头(10μL,200μL,1000μL)、灭菌双蒸水、称量纸。6 试剂和材料6. 1DNAzol? Reagent:DNA抽提试剂,外观为淡绿色,于4~8℃保存。6. 2Premix Ex TaqTM(Probe qPCR):TaqMan探针法进行Real time PCR反应的专用试剂,为 PCR Buffer、dNTP、RNaseH和HS Taq酶的预混液,于-20℃长期保存,融化后于4~8 ℃保存。6. 3PBS:磷酸盐缓冲液(0.02 mol/LpH7.2)。6. 4 无水乙醇:-20℃预冷。6. 575%乙醇:用无水乙醇和灭菌双蒸水配制,-20℃预冷。6. 6 阴性对照:灭菌双蒸水。6. 7 阳性对照:PCV2细胞培养物。注:本标准所用试剂,除特殊标注外,均为分析纯。7 操作步骤7. 1 样品的采集、前处理、存放和运送7. 1. 1 采样注意事项采样及样品前处理过程中应戴一次性手套,样本间不得交叉污染。7. 1. 2 采样工具药匙、15 mL离心管和1.5 mL离心管经121(±2)℃高压灭菌 15 min;剪刀、镊子经 160℃干热灭菌 2 h。7. 1. 3 内脏样品的采集与前处理采取病死或剖杀猪主要脏器(淋巴结、脾脏、肺脏、肾脏和肝脏)装入灭菌 15mL离心管中,编号,送实验室。取 100mg左右待检样品,按1:5倍体积加入PBS,于研钵或组织匀浆器中充分研磨,1 000 g离心15 min,取上清液,转入 1.5 mL离心管中编号备用。7. 1. 4 血液样品的采集与处理用无菌注射器采集血液,注入含1/10 4% EDTA溶液的无菌容器中,充分混匀,编号备用。7. 1. 5 粪便的采集与前处理2 DB21/ T2327—2014 用药匙采取猪新鲜粪便,装入 15 mL灭菌离心管中,按1:5倍体积加入PBS,混匀,1 000g离心15 min,取上清液,转入 1.5 mL离心管中编号备用。7. 1. 6 细胞培养物细胞培养物冻融3次,转入1.5 mL离心管中编号备用。7. 1. 7 存放与运送采集或处理的样品在 2~8 ℃条件下保存应不超过24 h;若需长期保存,应放置-70 ℃冰箱,但应避免反复冻融(冻融不超过 3次)。采集的样品密封后,采用保温壶或保温桶加冰密封,在6~8 h之内运送到实验室。按照《兽医实验室生物安全技术管理规范》进行样品的生物安全标识。7. 2 实时荧光PCR检测7. 2. 1DNA提取在核酸提取室进行。7. 2. 1. 1 取n个灭菌的1.5 mL离心管,其中n为待检样品数+阳性对照+阴性对照,对每个离心管进行编号。7. 2. 1. 2 每管加入800 μL DNAzol,分别加入被检样品、阳性对照、阴性对照各 200 μL,颠倒 10次混匀,室温静置 5 min;4℃ 10 000 g离心10 min。7. 2. 1. 3 取900μL上清,置新的 1.5 mL灭菌离心管中,加入500μL无水乙醇,混匀,室温放置3 min;