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LYT_3191-2020林木DNA条形码构建技术规程PDF

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更新时间:2021/11/1(发布于云南)
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文本描述
ICS 65.020 B 60 . . . . . LY 中华人民共和国林业行业标准 LY/T 3191—2020 . . . . . 林木DNA条形码构建技术规程 Technical regulations of DNA barcodes in woody species . . . . . 2020 - 03 - 30发布 2020 - 10 - 01实施 国家林业和草原局 发布 前 言 本标准 按照 GB/T1.1 — 2009 给出的规则起草。 本标准由 国家 林业 和草原 局 提出 。 本标准由 全国林木种子标准化技术委员会( SAC/TC115 ) 会 归口 。 本标准起草单位: 中国林业科学研究院 热带林业研究所 , 湖南省林业科 学院 , 中国科学院华南植物 园 , 中国科学院植物研究所 , 江西农业大学林学院 。 本标准主要起草人: 裴男才 、 梁军生 、 陈步峰 、 葛学军 、 米湘成 、 刘娟 。 林木 DNA 条形 码构建 技 术规程 1 范围 本标准规定了 林木 DNA 条形码 构建中 样本采集策略、核心 DNA 条形码片段选取标准、 DNA 提取 技术和保存、序列测定和编辑 方法 、系统发育关系构建 等技术要求 。 本标准适用于林木DNA条形码的构建。 2 规范性引用 文件 下列文件 对于本文件的应用是必不可少的。 凡是注日期的引用文件, 仅注日期的版本适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本( 包括所有的修改单 )适用于本 文件 。 SN/T 4625-2016 DNA条形码筛选与质量要求 SN/T 4626-2016 DNA条形码物种鉴定操作规程 SN/T 4714-2016 DNA条形码数据库技术规范 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本标准。 3 .1 DNA 条形码 DNA barcod es 是从线粒体、叶绿体或核基因组区域中筛选的一段短的通用的DNA序列,以期对现存生物在物种 水平上进行快速而准确的识别和鉴定。 3.2 引物 Primer 是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进 行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链。 3.3 聚合酶链式反应 Polymerase Chain Reaction (PCR) 一种体外酶促合成特异DNA片段的方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个 周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便省时等特点。 3.4 DNA序列 DNA sequence 多核苷酸链中的核苷酸的排列顺序。可能的字母只有A、C、G和T,分别代表组成DNA的四种核苷 酸——腺嘌呤,胞嘧啶,鸟嘌呤,胸腺嘧啶;无间隔地排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC。 3.5 DNA测序 DNA sequencing technology 对DNA分子的核苷酸排列顺序的测定,也就是测定组成DNA分子的A、T、G、C的排列顺序。 3.6 系统发育关系 Phylogeny 生物有机体随着时间变化而呈现的起源、演化历史及其亲缘关系。 3.7 简约法系统发育分析 Phylogenetic Analysis Using Parsimony (and Other Methods) (PAUP) 一款用于构建进化树(系统发育树)及进行相关检验的软件,包含了众多分子进化模型和方法,可利 用最大似然法、简约法、距离法等分析分子数据(DNA、蛋白质序列)、形态数据及其他类型数据。 3.8 系统发育研究赛百平台 Cyberinfrastructure for Phylogenetic Research (CIPRES) 一款为科研机构和研究人员设计和开放的远程超级计算机平台,可满足巨量数据的运行要求,能大 幅节约时间成本,提高运算结果的可靠性。 3.9 分子进化遗传分析软件 Molecular Evol。。。。。。以下内容略